L'Archivio storico conserva i documenti dell'amministrazione ospedaliera a partire dal secolo XI (talvolta muniti di miniature o sigilli e di rilevante importanza storica); per un totale di ca. 15.000 cartelle, 3600 registri, 16.000 pergamene, 700 mappe. La "Sezione amministrativa" conserva gli atti relativi alla vita dell'Ospedale tra XIX e XX secolo (tra cui la fondazione e l'amministrazione degli ospedali di Niguarda, Sesto San Giovanni, San Carlo fino allo scorporo avvenuto nel 1977). Alle serie principali sono uniti altri importanti fondi archivistici con documenti dal sec. XV al XX (Ospedale della Senavra, Santa Caterina alla Ruota, Congregazione di Caritą, Agenzie di campagna, OO.PP. Macchi, Del Sesto, Secco Comneno, Ponti, Parravicini), e Collezioni particolari con i materiali pił antichi e preziosi (diplomi, codici, autografi, pergamene archivi ereditari); archivi di terzi e donazioni (si segnala quello della famiglia Litta). I depositi dell'archivio si sviluppano per circa 3000 metri lineari di scaffalatura.

Il Servizio gestisce anche l'archivio di deposito per le pratiche esaurite da meno di 40 anni e ancora indispensabili all'amministrazione, inoltre conserva i registri dell'accettazione amministrativa degli ospedali Policlinico, Niguarda, Cernusco s.N. per gli anni 1893-1972.

Inventario della Sezione Amministrativa